cookies

lib/imp.js

@@ -253,12 +253,11 @@ $('#but-variant').on('change', function(){
 
 // set last tab in cookie
 $('#tabs a[data-toggle="tab"]').on('shown.bs.tab', function (e) {
-  Cookies.set('tab', '#' + e.target.id);
-  e.target
+  $.cookie('tab', $(e.target).attr('href'));
 })
 // show lat iopenned tab or first one
-if(Cookie.get('tab')){
-    $(Cookie.get('tab')).tab('show');
+if($.cookie('tab')){
+    $('#tabs li > a[href=' + $.cookie('tab') + ']').tab('show')
 } else {
     $('#tabs li:first > a').tab('show');
 }

rules/Util.rules

@@ -42,7 +42,6 @@ rule REPORT:
             "lib/bootstrap.min.css",
             "lib/bootstrap.min.js",
             "lib/imp.js",
-
         ] +
         expand(["{dir}/workflow.png", "{dir}/workflow.pdf"], dir=OUTPUTDIR)
     output:
@@ -56,7 +55,12 @@ rule REPORT:
             towrite = json.dumps(config)
             whandle.write("IMP_CONFIG = %s;" % towrite)
         shell("cp {input[0]} {params.outdir}/REPORT.html")
-        shell("cp {input[1:]} {params.outdir}")
+        shell("cp -f {input[1]} {params.outdir}")
+        shell("cp -f {input[2]} {params.outdir}")
+        shell("cp -f {input[3]} {params.outdir}")
+        shell("cp -f {input[4]} {params.outdir}")
+        shell("cp -f {input[5]} {params.outdir}")
+        shell("cp -f {input[6]} {params.outdir}")
 
 
 rule REPORT2: