added preliminary tests for map

test/map/ivls.bed

+chr1	0	100
+chr1	100	200
+chr2	0	100
+chr2	100	200
+chr3	0	100
+chr3	100	200

test/map/test-map.sh

+BT=../../bin/bedtools
+
+check()
+{
+	if diff $1 $2; then
+    	echo ok
+	else
+    	echo fail
+	fi
+}
+
+###########################################################
+#  Test defaults
+############################################################
+echo "    map.t01...\c"
+echo \
+"chr1	0	100	30
+chr1	100	200	1
+chr2	0	100	.
+chr2	100	200	.
+chr3	0	100	6
+chr3	100	200	4" > exp
+$BT map -a ivls.bed -b values.bed > obs
+check obs exp
+rm obs exp
+
+###########################################################
+#  Test sum
+############################################################
+echo "    map.t02...\c"
+echo \
+"chr1	0	100	30
+chr1	100	200	1
+chr2	0	100	.
+chr2	100	200	.
+chr3	0	100	6
+chr3	100	200	4" > exp
+$BT map -a ivls.bed -b values.bed -o sum > obs
+check obs exp
+rm obs exp
+
+
+###########################################################
+#  Test count
+############################################################
+echo "    map.t03...\c"
+echo \
+"chr1	0	100	3
+chr1	100	200	1
+chr2	0	100	0
+chr2	100	200	0
+chr3	0	100	3
+chr3	100	200	1" > exp
+$BT map -a ivls.bed -b values.bed -o count > obs
+check obs exp
+rm obs exp
+
+
+###########################################################
+#  Test mean
+############################################################
+echo "    map.t04...\c"
+echo \
+"chr1	0	100	10
+chr1	100	200	1
+chr2	0	100	.
+chr2	100	200	.
+chr3	0	100	2
+chr3	100	200	4" > exp
+$BT map -a ivls.bed -b values.bed -o mean > obs
+check obs exp
+rm obs exp
+
+###########################################################
+#  Test max
+############################################################
+echo "    map.t05...\c"
+echo \
+"chr1	0	100	15
+chr1	100	200	1
+chr2	0	100	.
+chr2	100	200	.
+chr3	0	100	3
+chr3	100	200	4" > exp
+$BT map -a ivls.bed -b values.bed -o max > obs
+check obs exp
+rm obs exp
+
+###########################################################
+#  Test min
+############################################################
+echo "    map.t06...\c"
+echo \
+"chr1	0	100	5
+chr1	100	200	1
+chr2	0	100	.
+chr2	100	200	.
+chr3	0	100	1
+chr3	100	200	4" > exp
+$BT map -a ivls.bed -b values.bed -o min > obs
+check obs exp
+rm obs exp
+
+###########################################################
+#  Test mode
+############################################################
+echo "    map.t07...\c"
+echo \
+"chr1	0	100	5
+chr1	100	200	1
+chr2	0	100	.
+chr2	100	200	.
+chr3	0	100	1
+chr3	100	200	4" > exp
+$BT map -a ivls.bed -b values2.bed -o mode > obs
+check obs exp
+rm obs exp
+
+###########################################################
+#  Test anti-mode
+############################################################
+echo "    map.t08...\c"
+echo \
+"chr1	0	100	10
+chr1	100	200	1
+chr2	0	100	.
+chr2	100	200	.
+chr3	0	100	1
+chr3	100	200	4" > exp
+$BT map -a ivls.bed -b values2.bed -o antimode > obs
+check obs exp
+rm obs exp
+

test/map/values.bed

+chr1	0	10	a1	10	+
+chr1	10	20	a2	5	+
+chr1	20	30	a3	15	+
+chr1	120	130	a4	1	+
+chr3	0	10	a5	1	+
+chr3	10	20	a6	2	+
+chr3	20	30	a7	3	+
+chr3	120	130	a8	4	+
\ No newline at end of file

test/map/values2.bed

+chr1	0	10	a1	10	+
+chr1	10	20	a2	5	+
+chr1	11	21	a3	5	+
+chr1	20	30	a4	15	+
+chr1	120	130	a5	1	+
+chr3	0	10	a6	1	+
+chr3	10	20	a7	2	+
+chr3	20	30	a8	3	+
+chr3	120	130	a9	4	+
+chr3	120	130	a9	4	+

test/map/values3.bed

+chr1	0	10	a1	10	+
+chr1	10	20	a2	5	+
+chr1	11	21	a3	5	+
+chr1	20	30	a4	15	+
+chr1	20	30	a5	15	+
+chr1	20	30	a6	15	+
+chr1	120	130	a7	1	+
+chr3	0	10	a8	1	+
+chr3	10	20	a9	2	+
+chr3	20	30	a10	3	+
+chr3	120	130	a11	4	+
+chr3	120	130	a12	4	+